Agaroza i poliakryloamid
Istnieją różne różnice dotyczące agarozy i poliakryloamidu, w tym ich struktura fizyczna, toksyczność i metody ich wylewania, a także ich cena. Warto poznać te różnice, a także ich podobieństwa, jeśli mamy do czynienia z którymś z tych typów żeli.
Jedną z głównych różnic między tymi dwoma żelami jest to, że agaroza wylewa się w poziomie, a poliakrylamid wlewa się pionowo. O wiele łatwiej jest wlewać agarozę w ten horyzontalny sposób. Agarozę można podgrzać, aby wspomóc proces nalewania, chociaż nie należy jej ogrzewać w tak dużym stopniu, aby agaroza mogła się topić. Można również zdecydować, czy użyć wąskich czy szerokich pasów do wlewania agarozy. Można go wylewać za pomocą tej metody rowkowania, a to jest jedna z jego zalet. Podczas nalewania należy zachować szczególną ostrożność, ponieważ agaroza jest bardzo delikatna i łatwo się łamie.
Z drugiej strony, jak wspomniano, poliakryloamid wylewa się pionowo. Poliakrylamid potrzebuje szklanych płytek, aby pomóc w tym procesie, ponieważ jego struktura jest bardzo cienka, a to dodatkowe wsparcie jest konieczne. W przeciwieństwie do agarozy, poliakrylamidu nie można ponownie podgrzać, a następnie wylać.
Agaroza składa się z wielu cząsteczek, podczas gdy poliakryloamid ogólnie składa się tylko z jednej dużej cząsteczki. Cząsteczki agaroz są utrzymywane razem przez siły międzycząsteczkowe, a cząsteczki składają się z DNA. Istnieją duże i małe cząsteczki, a ogólnie większe cząsteczki są łatwiej rozdzielane niż mniejsze. Cząsteczka poliakryloamidu składa się z DNA lub białka. Odstępy między żelami poliakryloamidu są mniejsze niż między żelami agarozowymi, co stanowi kolejną różnicę między tymi dwoma substancjami. Gdy wielkość pasm jest taka sama w agarozie, w poliakryloamidzie występują różne wielkości pasm. Jeżeli cząsteczka poliakrylamidu jest wystawiona na działanie powietrza, nie będzie ona krzepła w równomierny sposób, ponieważ powietrze przyspiesza proces polimeryzacji.
Jeśli chodzi o toksyczność, agaroza jest uważana za substancję nietoksyczną. Podczas gdy poliakryloamid jest uważany za taki sam, jego proszek uważa się za toksyczny i rozsądne jest nawet posługiwanie się żelami za pomocą środków ochronnych.
Poliakryloamid stosuje się do sekwencjonowania żeli i żeli białkowych. Jego zaletą jest to, że ma łatwe właściwości barwienia i może być suszony do postaci żelu. Jest kupowany przed nalaniem i jest tańszy niż agaroza, około 5 "7 za żel. (Agarose wynosi około 1 USD za gram). Przed zakupem któregokolwiek z tych dwóch żeli zalecane jest posiadanie wystarczającego doświadczenia, ponieważ często przed zakupem należy znać liczbę potrzebnych próbek i wymaganą koncentrację żelu.
Streszczenie:
1.Agarose wylewa się poziomo, a poliakryloamid wylewa się pionowo. 2.Agaroza jest droższa niż poliakryloamid. 3.Agaroza składa się z wielu cząsteczek, podczas gdy poliakryloamid składa się tylko z jednej dużej cząsteczki. 4. Podobnie jak poliakrylamid, agarozę można ponownie ogrzewać. 5.Agaroza jest uważana za nietoksyczną substancję we wszystkich jej postaciach, natomiast proszek poliakryloamidowy jest toksyczny.
